流逝才慢慢的消弭。
光月桃之助在和之国复辟势力的蛊惑之下终究按耐不住野心，趁日和前往方舟参与世界议会时发动反叛，试图再次闭关锁国。
锦文门，雷藏两位原赤鞘九侠带着少主擅自闯入和之国议会厅宣布继承将军位。
内乱发生后花之都乱成一团，小菊猝不及防之下被偷袭重伤，最终为了保护花之都内的新生代学者奋战不休力竭而亡。
随后在大和以及传次郎带领的留学武士群体面前复辟势力被打的溃不成军。
锦文门，雷藏，光月桃之助被擒下。
光月日和赶回后沉默三日，最后亲手处死了桃之助。锦文门和雷藏送往监察部接受绞刑。
自觉有愧于和之国和小菊，日和最终辞去议会长之职离开了和之国不知所踪。
霜月耕四郎因为在最后一战中深受重伤，即便经过了罗等人的救治可是本源的损伤无法挽救。
至于千年龙的生命药剂他也拒绝服用，对于死亡的归途欣然接受。
在海圆历1529年平静的离开了这个世界。
“我这一生没有什么可以后悔的，霜月剑道在自己的手中已经达到了历任先祖都不曾到过的地方，死亦无憾。”
于是索隆结束外出修行，回到霜月村继承了霜月道馆。
月见博士在胜利之后的第6年也在碧卡逝世。
遗言中说在生命最后的二十年中是他一生中最具有挑战的时光，那种初始的研究科学的热情重新归来。
研究出来的一切都是有意义的，不是空中楼阁。
能够造福全大海的杰作之中有一大部分都是自己的成果，这一点比贝加庞克都要多。
虽然两人研究路线不同，可是博士却骄傲的不得了。
最后把所有的研究成果无偿的捐献给议会，希望科学的理念可以永远不要沉寂。
初代教育部长罗宾在完成了革命教育的初步工作之后在两年前也离职了。
自己回到了西海，拜托鱼人族的同志们帮助升上来一截岛屿，通过科技手段维持在了海面之上。
在那里重新撒下了无数的花朵种子，又栽下了来自巨人国提供的世界树的幼苗，据说全知之树的树苗便是来自于那里。
罗宾没有想过这棵树苗能长多大，只是留下一个寄托而已。
在原地留重新盖起了一座巨大的图书馆。来自世界各地的书籍，还有她近些年翻译的所有的历史资料都放在了这里。
没有书籍的全知之树算什么新奥哈拉呢。
最终这一次方舟的教育之旅结束，这批年轻人即将步入建设大海新世界的浪潮中去。
十年时间就是如此残酷，不以任何人的意志所偏转。
此时二代议会长蒙奇.d.龙正坐在议会厅之中开紧急会议。
可以决定世界命运走向的几位部长和各个大型国家的代表都来到了这里，这场小会上他们在讨论一个很棘手的事情。
“你是说他真的消失了很久吗？”