，方百花和方杰放弃了复国的念头，但是他们强烈要求如果卢俊义推翻赵宋朝廷做了皇帝以后，方杰必须封王，称为明王，世代世袭。卢俊义心中冷笑道，封王可以，在日后的京城里盖一间王府养一群废物有甚不可，至于封土就不要妄想了。做为对这个条件的补偿，方百花和方杰同意将所有明教将领和明教教徒都交给卢俊义指挥编制。不过一心为兄长后裔谋划的方百花还提到：“卢公必须同意明教在此地传教，明教教主由方杰担任。
”卢俊义对方杰担任这个已经完全由自己控制的明教教主并无异议，但完全不同意明教在齐国领地传教，不过指点他明教可以派人联系回鹘后人在西域各国、吐蕃、西夏、蒙古各地传教，同时卢俊义还要求明教不准禁止教徒改信其他教派如玄教，方百花和方杰在卢俊义反复威逼利诱下只得答应了。
卢俊义接过对明教将领和教徒的指挥权之后，并没有将这些将领和教徒马上安排进正规军，而是进行了整编。
将近三分之二的明教教徒厌倦战争愿意耕田，便将其派往汉南、汉北两道或北海、中海、东海三道屯田，随着这些明教教徒前去的还有一道密令，诏令宗教事务总署在那五道的人员加强对这些人的说服教育工作，务必使得他们放弃信仰改信玄教。
剩下三分之一的明教教徒中，有二分之一也厌倦战争，但是他们依然深信明教教义，便被派往女真、蒙古、西夏、吐蕃等地传教兼做商业贸易，而且还做情报工作。
只有四万多人明教教徒想在战争中杀死宋兵替死去的教友或亲人报仇雪恨，卢俊义便将警卫军升上来的人马跟明教一般教徒打散在一起，将禁卫军又扩编了一个军。第五军军长为王寅，方杰、方百花为副军长，王寅、石宝、厉天、司行方、庞万春为各师的师长，同时厉天佑、吴值、黄爱、晁中、薛斗南、徐白、张韬、贝应夔、白钦、夏侯成、雷炯、计稷、高玉、杜微则被安排到另外四个军中做副师长或团长，其他四个军中一些副师长或团长抽掉过来到第五军做副师长或团长，而方百花、庞秋霞则建立了一个女兵团，隶属于第五军第一师指挥。而号称浙江四龙的原方腊水军四位总管成贵、翟源、乔正、谢福则称为张顺、刘梦龙两只水军中的副师长或团长级。而包道乙和郑彪二人则编入宗教事务总署负责道术传授。
所有的明教将领先期都会进入梁山军校军官成班脱产学习三个月乃至六个月，日后还会进行不间断的学习，一方面从无到有地增加增强这些明教将领的军事知识素养，一方面则是进行一些洗脑活动，务必使得他们跟其他齐国将领们的思维思路一样，开始在心底深处建立对卢俊义的顶礼膜拜。(未完待续，)
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